1897年（明治30年）2月15日、京都鉄道開業当初の終着駅、嵯峨駅として開業。

1907年（明治40年）8月1日、京都鉄道が国有化され、国鉄の駅となる。

1994年（平成6年）9月4日、嵯峨嵐山駅に改称。